Рекомбинантные механизмы лежат в основе возникновения и гетерозигот. В классической генетике этим термином определяют организм, в диплоидном наборе хромосом которого содержатся два различных аллеля какого-либо гена. У большинства вирусов животных такого рода гетерозиготность не наблюдается, поскольку их геномы гаплоидны. Гетерозиготными по всем маркерам могут быть ретровирусы, содержащие две копии геномной РНК. Гетерозиготность ретровирусов связывают с рекомбинационным процессом.
У некоторых ДНК-вирусов (например, герпеса), имеются повторяющиеся последовательности и эти вирусы частично диплоидны. В этих диплоидных локусах также может возникать гетерозиготность (Vadsworth е. а., 1975). Так, выделено несколько типов рекомбинантов при скрещивании вирусов герпеса типа 1 и 2, которые содержали гетерозиготные терминальные повторяющиеся последовательности.
Перспективы практического применения рекомбинационной изменчивости во многом связаны с получением живых рекомбинантных вакцин. Таким образом, генетическая рекомбинация является удобным методом преобразования биологических свойств вирусов. Однако рекомбинация с успехом используется пока лишь для передачи признака ослабленной патогенности, на чем основано новое направление применения 1з-мутантов для конструирования живых вакцин. Закономерности же передачи и наследования других «полезных» свойств изучены еще недостаточно. Существуют неоднократные указания на большие затруднения в использовании рекомбинации для быстрого выведения высокоурожайных штаммов, пригодных для производства гриппозных вакцин и вирусных диагностикумов (Горев, Ермаченко, 1983). Пока нет какой-либо коллекции мутантов, несущих признак высокой репродуктивной активности.