Второй период развития генетики вирусов связан с разработкой R. Dulbecco метода бляшек. Первое применение метода в генетических целях связано с получением чистой линии вируса полиомиелита. Позже на его основе были созданы способы селекции чистых клонов многих цитолитических вирусов. При этом полученные клоны были свободны не только от гетерогенных контаминантов, но и от собственных ДИ-частиц. Использование бляшкообразуюшей способности вирусов сделало возможным более точный количественный анализ их потомства, а также получение и изучение системы условно-летальных мутантов.
Анализ системы условно-летальных мутантов сыграл в то время важную роль в генетике вирусов гриппа. На основании четкого разделения ts-мутантов, по крайней мере, на 5 комплементационных групп генетиками было высказано предположение о фрагментарности их генома задолго до молекулярно-биологических ее доказательств. Установился ряд направлений генетических исследований, использующих ts-мутанты вирусов гриппа: 1) изучение организации и функции генома с составлением его карты; 2) генетический анализ механизмов рекомбинации и реактивации; 3) исследование молекулярно-биологических событий в зараженной клетке; 4) разработка путей получения аттенуированных вирусов (Гендон, 1975).
Таким образом, метод бляшек позволил применить к вирусам традиционный генетический анализ, основанный на получении мутантов и рекомбинантов, различающихся по типу бляшек и условию их образования. Поэтому не удивительно, что многие данные по генетике вирусов получены в связи с внедрением этого метода. Определение приложимости метода считается главным пререквизитом для генетических исследований ранее не изученных вирусов.