Для картирования генома вирусов используются два основных подхода: генетический и биохимический. В соответствии с этим составляются разные типы карт — генетические, физические и биохимические. Эти подходы не исключают, а наоборот, дополняют друг друга, так как их возникновение связано с особенностями структуры и функции генетического материала различных классов вирусов. Ко многим вирусам, например, не вступающим в рекомбинационные взаимоотношения, нельзя было применить классические методы картирования. В других случаях определенные помехи вносили образование в популяции ряда скрещиваний комплементирующих гетерозигот. Эти и другие факторы способствовали значительной вариабельности получаемых данных. А генетико-биохимический подход не только расширяет возможность картирования с внесением дополнительных характеристик, но и повышает точность карт. Наиболее точно картирован тот ген, или геном, у которого генетические и физико-химические карты находят наибольшее соответствие.
